أعرب زعيم جمعية علماء الإسلام (ف) مولانا فضل الرحمن عن عدم ارتياحه إزاء تشكل المحاكم العسكرية، مضيفاً أن الأحزاب المتحالفة مع الحزب الحاكم غير راغبة أيضاً حول تشكيل هذه المحاكم، وأنه يخشى أن يتخطى نشاط هذه المحاكم الأطر الدستورية، وأشار أن نقطة الحملة ضد المدارس الدينية التي تم وضعها في الخطة الوطنية لمكافحة الإرهاب سيستهدف بموجبها المدارس الدينية التي يرعاها هو شخصياً.